Bij de kruising met de Giessen ligt het tracé van de Betuweroute niet direct naast de bestaande spoorlijn Dordrecht-Geldermalsen of de A15. Om de bebouwing van Hardinxveld-Giessendam te sparen bevindt het tracé zich meer naar het noorden.

De Betuweroute kruist de Giessen in een tunnel. Deze tunnel is aangelegd in een bouwkuip. Uitgangspunt hierbij was dat de bouw van de tunnel de waterafvoer en de doorvaart op de Giessen niet mocht hinderen. Daarom vond de bouw in twee fasen plaats. Eerst wordt in een bouwkuip één tunnelhelft met toerit gebouwd, daarna wordt het tweede deel in een tweede bouwkuip gerealiseerd.

De tunnel loopt onder de beide dijken van de Giessen door. De bakconstructies van de toeritten liggen dus binnendijks. De tunnel heeft een lengte van circa vijfhonderd meter en kent voor de toeritten twee open bakken van vierhonderd meter in het oosten en vierhonderdnegentig meter in het westen.